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| Registros recuperados : 37 | |
| 3. |  | RODRIGUES, H. P.; SILVA, D. C. G. da; FERREIRA, E. G. C.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Otimização de ensaios de PCR Multiplex para a amplificação de alvos de interesse para o melhoramento genético da Soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 15., 2020, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2020. 244 p. (Embrapa Soja. Documentos, 429). p. 202-210 (Embrapa Soja. Documentos, 429). Artigo de acesso aberto.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | AVELINO, B. B.; FERREIRA, E. G. C.; SILVA, D. C. G. da; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Otimização de um método de extração de DNA de sementes de soja não destrutivo. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 15., 2020, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2020. 244 p. (Embrapa Soja. Documentos, 429). p. 234-243 (Embrapa Soja. Documentos, 429). Artigo de acesso aberto.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 5. | | FRAGA, T. R.; MEDRI, M.; ABDELNOOR, R. V.; MEDRI, C.; RINCÃO, M. P.; COSTA, F. G.; OLIVEIRA, M. C. N. de; SILVA, D. C. G. da. Anatomia do processo infeccioso da ferrugem asiática em folhas de soja. In: ENCONTRO ANUAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 18., 2009, Londrina. Anais... Londrina: Universidade Estadual de Londrina, 2009. Ref. 4207.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 6. | | PASSIANOTTO, A. L. de L.; SILVA, D. C. G. da; NOGUEIRA, L. M.; SANTOS, J. V. M. dos; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; YAMANAKA, N. Caracterização de dois genes de resistência à ferrugem asiática da soja, Rpp2 e Rpp4, utilizando marcadores moleculares. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 32, p. S209, ago. 2007. Suplemento, resumo 0497. Edição dos Resumos do XL Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Maringá, PR, ago. 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 7. | | CARDOSO, R.; SILVA, A. C. da; SOUZA JUNIOR, H. de; FRESTRAS, L. A.; KUWAHARA, M. K.; SILVA, D. C. G. da; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Genome-Wide Association Study (GWAS) para resistência a Xanthomonas axonopodis pv. glycines. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 15., 2020, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2020. 244 p. (Embrapa Soja. Documentos, 429). p. 60-67 (Embrapa Soja. Documentos, 429). Artigo de acesso aberto.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 8. | | NOGUEIRA, L. M.; PASSIANOTTO, A. L. L.; SILVA, D. C. G. da; SANTOS, J. V. M.; ARIAS, C. A. A.; ABDELNOOR, R. V.; YAMANAKA, N. Os genes de resistência à ferrugem asiática da soja, Rpp2 e Rpp4, apresentam efeitos não-aditivos quando acumulados em uma variedade. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S 204, ago. 2008. Suplemento. Edição dos Resumos apresentado no XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, ago., 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 9. | | POLIZEL, A. M. L.; BROGIN, R. L.; SILVA, D. C. G. da; YAMANAKA, N.; CATELLI, L. L.; MARIN, S. S. R.; ABDELNOOR, R. V. Mapeamento molecular de um gene de resistência à ferrugem da soja oriundo da cultivar FT-2. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: SBG, 2005. 1 CD-ROM. Seção: Genética de Plantas - Resumos: Pdf. 465.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 10. | | AVELINO, B. B.; BARROS, L. G.; SILVA, D. C. G. da; FERREIRA, E. G. C.; ARIAS, C. A. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Refinamento do mapa do locus de resistência a ferrugem da soja na PI 594756 por montagem genômica de novo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 12., 2023, Caxambu, MG. Anais... Piracicaba: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2023. Título em inglês: Refinement of the resistance locus to soybean rust in PI 594756 by de novo genome assembly.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 11. | | PASSIANOTTO, A. L. de L.; NOGUEIRA, L. M.; SILVA, D. C. G. da; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N. Resistência à ferrugem asiática da soja em genótipos do Japão e do Nordeste da China. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 180-185. (Embrapa Soja. Documentos, 276).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 12. | | PASSIANOTTO, A. L. de L.; NOGUEIRA, L. M.; SILVA, D. C. G. da; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N. Resistência à ferrugem asiática da soja em genótipos do Japão e do Noroeste da China. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 4., 2006, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 104-105. Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 13. | | SOUZA, L. G. de; SILVA, D. C. G. da; SILVEIRA, C. A. da; MARIN, S. R.; SANTOS, J. V. M. dos; YAMANAKA, N.; ABDELNOOR, R. V. Saturação de regiões genômicas da soja associadas a genes de resistência à ferrugem asiática. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 3., 2008, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 22-25 (Embrapa Soja. Documentos, 297).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 14. | | YAMANAKA, N.; SILVA, D. C. G. da; GILLI, J. R.; FUENTES, F. H.; YANG, Z.; POLIZEL, A.; SATO, H.; WATANABE, S.; BAN, T.; HOMMA, Y.; HARADA, K.; BROGIN, R. L.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V. Application of DNA markers for identifying genes for resistance to soybean diseases in South America and for evaluating genetic relationships among soybean gene pools. In: SUENAGA, K.; KUDO, H.; OSHIO, S. (Ed.). Comprehensive studies on the development of sustainable soybean production technology in South America. Tsukuba: JIRCAS, 2007. p. 47-53. (JIRCAS Working Report, 51).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 15. | | CASTANHO, F. M.; KUWAHARA, M. K.; FERNANDES, G. P.; DARBEN, L. M.; YOKOYAMA, A.; SILVA, D. C. G. da; ABDELNOOR, R. V.; MEYER, M. C.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Characterization of Phakopsora pachyrhizi races from a broad geographical and temporal collection. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno, editores técnicos. resumo 105. p. 124.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 16. | | SILVA, A. C.; SILVA, D. C. G. da; FERREIRA, E. G. C.; BORÉM, A.; FERREIRA, M. E.; ARIAS, C. A. A.; OLIVEIRA, M. F. de; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Development of the 1K SNP panel for genetics and breeding applications for the Brazilian soybean germplasm. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 11., 2023, Vienna. Soybean Research for Sustainable Development. abstracts. Vienna: University of Natural Resources and Life Sciences, 2023. 11 p.224. WSRC 2023| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 17. | | SANTOS, J. V. M. dos; YAMANAKA, N.; SILVA, D. C. G. da; PASSIANOTTO, A. L. de L.; NOGUEIRA, L. M.; TOBITA, S.; ARIAS, C. A. A.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V. Desenvolvimento de linhagens endogâmicas recombinantes para a análise genética da tolerância à ferrugem asiática da soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais... São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007. 1 CD-ROM. Pdf. 279.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 18. | | SANTOS, J. V. M. dos; YAMANAKA, N.; SILVA, D. C. G. da; PASSIANOTTO, A. L. L.; NOGUEIRA, L. M.; TOBITA, S.; ARIAS, C. A. A.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V. Desenvolvimento de linhagens endogâmicas recombinantes para a análise genética da tolerância à ferrugem asiática da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 3., 2008, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 82-86 (Embrapa Soja. Documentos, 297).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 19. | | CHICOWSKI, A. S.; SILVA, D. C. G. da; SANTOS, A. B. dos; SANTOS, J. V. M. dos; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; ARIAS, C. A. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Desenvolvimento de ensaios KASP para seleção genotípica da resistência a Phakopsora pachyrhizi em soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 11., 2016, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2016. p. 111-121. (Embrapa Soja. Documentos, 373).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 20. | | ALEKCEVETCH, J. C.; PASSIANOTTO, A. L. de L.; FERREIRA, E. G. C.; SANTOS, A. B. dos; SILVA, D. C. G. da; DIAS, W. P.; BELZILE, F.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Genome-wide association study for resistance to the Meloidogyne javanica causing root-knot nematode in soybean. Theoretical and Applied Genetics, v. 134, p. 777-792, 2021. Artigo de acesso aberto.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| Registros recuperados : 37 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
24/03/2021 |
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Data da última atualização: |
03/05/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
ALEKCEVETCH, J. C.; PASSIANOTTO, A. L. de L.; FERREIRA, E. G. C.; SANTOS, A. B. dos; SILVA, D. C. G. da; DIAS, W. P.; BELZILE, F.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. |
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Afiliação: |
JEAN CARLOS ALEKCEVETCH, Universidade Estadual de Londrina, UEL, Londrina, PR.; ANDRÉ LUIZ DE LIMA PASSIANOTTO, University of Guelph, Guelph, Canada.; EVERTON GERALDO CAPOTE FERREIRA, Universidade Estadual de Londrina, UEL, Londrina, PR.; ADRIANA BROMBINI DOS SANTOS, CNPSO; DANIELLE CRISTINA GREGORIO DA SILVA, CNPSO; WALDIR PEREIRA DIAS, CNPSO; FRANÇOIS BELZILE, Université Laval, Quebec City, Quebec , Canada.; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARA, CNPSO. |
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Título: |
Genome-wide association study for resistance to the Meloidogyne javanica causing root-knot nematode in soybean. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v. 134, p. 777-792, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00122-020-03723-9 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Artigo de acesso aberto. |
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Conteúdo: |
Key message A locus on chromosome 13, containing multiple TIR-NB-LRR genes and SNPs associated with M. javanica resistance, was identified using a combination of GWAS, resequencing, genetic mapping and expression profiling. Abstract Meloidogyne javanica, a root-knot nematode, is an important problem in soybean-growing areas, leading to severe yield losses. Some accessions have been identified carrying resistance loci to this nematode. In this study, a set of 317 soybean accessions was characterized for resistance to M. javanica. A genome-wide association study was performed using SNPs from genotyping-by-sequencing, and a region of 29.2 kb on chromosome 13 was identified. An analysis of haplotypes showed that SNPs were able to discriminate between susceptible and resistant accessions, with 25 accessions sharing the haplotype associated with resistance. Furthermore, five accessions that exhibited resistance without carrying this haplotype may carry different loci conferring resistance to M. javanica. We also conducted the screening of the SNPs in the USDA soybean germplasm, revealing that several soybean accessions previously reported as resistant to other nematodes also shared the resistance haplotype on chromosome 13. Two SNP-based TaqMan® assays were developed and validated in two panels of soybean cultivars and in biparental populations. In silico analysis of the region associated with resistance identified the occurrence of genes with structural similarity with classical major resistance genes (NBS-LRR genes). Specifically, several nonsynonymous SNPs were observed in Glyma.13g194800 and Glyma.13g194900. The expression profile of these candidate genes demonstrated that the two gene models were up-regulated in the resistance source PI 505,099 after nematode infection. Overall, the SNPs associated with resistance and the genes identified constitute an important tool for introgression of resistance to the root-knot nematode by marker-assisted selection in soybean breeding programs. MenosKey message A locus on chromosome 13, containing multiple TIR-NB-LRR genes and SNPs associated with M. javanica resistance, was identified using a combination of GWAS, resequencing, genetic mapping and expression profiling. Abstract Meloidogyne javanica, a root-knot nematode, is an important problem in soybean-growing areas, leading to severe yield losses. Some accessions have been identified carrying resistance loci to this nematode. In this study, a set of 317 soybean accessions was characterized for resistance to M. javanica. A genome-wide association study was performed using SNPs from genotyping-by-sequencing, and a region of 29.2 kb on chromosome 13 was identified. An analysis of haplotypes showed that SNPs were able to discriminate between susceptible and resistant accessions, with 25 accessions sharing the haplotype associated with resistance. Furthermore, five accessions that exhibited resistance without carrying this haplotype may carry different loci conferring resistance to M. javanica. We also conducted the screening of the SNPs in the USDA soybean germplasm, revealing that several soybean accessions previously reported as resistant to other nematodes also shared the resistance haplotype on chromosome 13. Two SNP-based TaqMan® assays were developed and validated in two panels of soybean cultivars and in biparental populations. In silico analysis of the region associated with resistance identified the occurrence of genes with structural similarity with classical ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Galha; Genoma; Meloidogyne Javanica; Nematóide; Resistência; Soja. |
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Thesaurus NAL: |
Genome-wide association study; Resistance mechanisms; Root-knot nematodes; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/222104/1/Alekcevetch2021-Article-Genome-wideAssociationStudyFor.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/222143/1/Alekcevetch2021-Article-Genome-wideAssociationStudyFor.pdf
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Marc: |
LEADER 03125naa a2200361 a 4500
001 2130887
005 2021-05-03
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00122-020-03723-9$2DOI
100 1 $aALEKCEVETCH, J. C.
245 $aGenome-wide association study for resistance to the Meloidogyne javanica causing root-knot nematode in soybean.$h[electronic resource]
260 $c2021
500 $aArtigo de acesso aberto.
520 $aKey message A locus on chromosome 13, containing multiple TIR-NB-LRR genes and SNPs associated with M. javanica resistance, was identified using a combination of GWAS, resequencing, genetic mapping and expression profiling. Abstract Meloidogyne javanica, a root-knot nematode, is an important problem in soybean-growing areas, leading to severe yield losses. Some accessions have been identified carrying resistance loci to this nematode. In this study, a set of 317 soybean accessions was characterized for resistance to M. javanica. A genome-wide association study was performed using SNPs from genotyping-by-sequencing, and a region of 29.2 kb on chromosome 13 was identified. An analysis of haplotypes showed that SNPs were able to discriminate between susceptible and resistant accessions, with 25 accessions sharing the haplotype associated with resistance. Furthermore, five accessions that exhibited resistance without carrying this haplotype may carry different loci conferring resistance to M. javanica. We also conducted the screening of the SNPs in the USDA soybean germplasm, revealing that several soybean accessions previously reported as resistant to other nematodes also shared the resistance haplotype on chromosome 13. Two SNP-based TaqMan® assays were developed and validated in two panels of soybean cultivars and in biparental populations. In silico analysis of the region associated with resistance identified the occurrence of genes with structural similarity with classical major resistance genes (NBS-LRR genes). Specifically, several nonsynonymous SNPs were observed in Glyma.13g194800 and Glyma.13g194900. The expression profile of these candidate genes demonstrated that the two gene models were up-regulated in the resistance source PI 505,099 after nematode infection. Overall, the SNPs associated with resistance and the genes identified constitute an important tool for introgression of resistance to the root-knot nematode by marker-assisted selection in soybean breeding programs.
650 $aGenome-wide association study
650 $aResistance mechanisms
650 $aRoot-knot nematodes
650 $aSoybeans
650 $aGalha
650 $aGenoma
650 $aMeloidogyne Javanica
650 $aNematóide
650 $aResistência
650 $aSoja
700 1 $aPASSIANOTTO, A. L. de L.
700 1 $aFERREIRA, E. G. C.
700 1 $aSANTOS, A. B. dos
700 1 $aSILVA, D. C. G. da
700 1 $aDIAS, W. P.
700 1 $aBELZILE, F.
700 1 $aABDELNOOR, R. V.
700 1 $aMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.
773 $tTheoretical and Applied Genetics$gv. 134, p. 777-792, 2021.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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